Public data
HCA Data Portal Human Cell Atlasで開発されたデータベース。2021年6月時点では55種類のヒト組織に由来する92プロジェクトのシングルセルデータが登録されている。 data.humancellatlas.org HCA Data Portalには基本的にユーザーにより登録されたデータが公…
代謝産物のデータベース GC-MSやLC-MSなどでヒト資料から取得したメタボロームデータのUntargeted解析*1を実施すると、全ピークのうち既知の物質へ帰属できるものは僅か1.8%しかないという報告がある*2。(素人目に見ても)ある意味宝の山とも言えるメタボロー…
cBioPortalとは がんに由来する大規模・多種類オミクスデータを整理し、誰もが探索的なデータ利用をできるようにしたプラットフォーム。解析に明るく無くてもGUIで簡単に可視化ができる環境が用意されている。 上記の文献が発表された2013年当時は"TCGA + 10…
