bioBakery bioBakeryはHarvardのCurtis Huttenhowerのグループが開発したマイクロバイオーム解析のツール群である。マイクロバイオーム関連の研究を見ているとよく名前が出てくるツールが多数含まれているので、改めてどのようなツールが提供されているのか…
はじめに Trajectory inferenceはscRNA-seqデータから細胞状態の遷移パターンを推定する解析手法である。一般的にはこれらの手法は、細胞の遺伝子発現データの分布から、どの細胞種(細胞サブセット)が連続的な関係にあるかを推定することができるが、「ど…
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